Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd3eP22646 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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