Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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