Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Col5a1O88207 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Col5a1O88207 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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