Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Cxcl13O55038 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Cxcl13O55038 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Cxcl13O55038 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl13O55038 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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