Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms