Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17078M0QW51 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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