Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
BC117090L7N257 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
BC117090L7N257 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms