Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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