Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm379J3QQ19 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm379J3QQ19 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm379J3QQ19 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm379J3QQ19 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm379J3QQ19 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm379J3QQ19 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm379J3QQ19 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm379J3QQ19 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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