Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Irx6-202ENSMUST00000167261 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm14461-201ENSMUST00000067618 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Gm21887J3QQ04 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tubd1-202ENSMUST00000069503 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Gm21887J3QQ04 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Gm21887J3QQ04 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r193-201ENSMUST00000057516 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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