Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8356J3QPD3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms