Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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