Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm3415J3QMS8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm3415J3QMS8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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