Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms