Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm21818J3KMS6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm21818J3KMS6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21818J3KMS6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21818J3KMS6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21818J3KMS6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21818J3KMS6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21818J3KMS6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21818J3KMS6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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