Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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