Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms