Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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