Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zbed5B2RPU8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms