Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms