Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms