Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms