Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atp8b5A3FIN4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atp8b5A3FIN4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atp8b5A3FIN4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Atp8b5A3FIN4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Atp8b5A3FIN4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Atp8b5A3FIN4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atp8b5A3FIN4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atp8b5A3FIN4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atp8b5A3FIN4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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