Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms