Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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