Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms