Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tuba8Q9JJZ2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tuba8Q9JJZ2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tuba8Q9JJZ2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tuba8Q9JJZ2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tuba8Q9JJZ2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tuba8Q9JJZ2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tuba8Q9JJZ2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba8Q9JJZ2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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