Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Pgpep1Q9ESW8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms