Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rb1cc1Q9ESK9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rb1cc1Q9ESK9 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rb1cc1Q9ESK9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms