Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DysfQ9ESD7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms