Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn4aQ9ER60 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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