Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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