Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pop5Q9DB28 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pop5Q9DB28 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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