Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D8N1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D8N1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D8N1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D8N1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D8N1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D8N1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D8N1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D8N1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D8N1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D8N1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms