Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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