Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mms19Q9D071 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mms19Q9D071 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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