Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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