Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih4Q9CX13 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cnih4Q9CX13 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cnih4Q9CX13 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cnih4Q9CX13 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cnih4Q9CX13 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cnih4Q9CX13 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cnih4Q9CX13 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cnih4Q9CX13 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih4Q9CX13 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms