Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms