Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms