Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rab28Q99KL7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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