Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Lims1Q99JW4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lims1Q99JW4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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