Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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