Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms