Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms