Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE8

Fbxw17, F-box and WD-40 domain protein 17, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw17Q8CFE8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fbxw17Q8CFE8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fbxw17Q8CFE8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fbxw17Q8CFE8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fbxw17Q8CFE8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fbxw17Q8CFE8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fbxw17Q8CFE8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fbxw17Q8CFE8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxw17Q8CFE8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms