Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms