Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms