Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms