Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms